Rakenduste hulka kuuluvad jõgede silt eemaldamine, järvede süvendamine ja sadamate ehitamine. Amfiibsüvendajatel on linnade veeteede haldamisel eriti oluline roll; need mitte ainult ei eemalda muda, vaid koguvad ka hõljuvat prahti, aidates hoida vett puhtana. Lisaks on need süvendajad silmapaistvad ranniku maaparanduses ja navigatsioonikanalite korrashoius.
Tänu oma erakordsele kohanemisvõimele ja tõhususele kasutatakse amfiibsüvendajaid laialdaselt erinevates sektorites:
Jõe majandamine: muda puhastamine jõesängidest, et parandada laevatatavust ja üleujutuste kontrolli.
Järvedest puhastamine: põhjasetete eemaldamine vee kvaliteedi parandamiseks ja ökoloogilise keskkonna kaitsmiseks.
Sadama hooldus: regulaarne süvendustööde läbiviimine sadamaaladel, et tagada laevade ohutu sisenemine ja väljumine.
Märgalade taastamine: Ökoloogilise taastamise läbiviimine märgalade keskkondades looduslike märgalade funktsioonide taaselustamiseks.